Som ung tilbragte amerikaneren Daniel Peters et ür i Danmark som udvekslingsstudent. Nu 25 ür senere arbejder han som oversÌtter pü Kierkegaard Forskningscenteret i København, da hans chef og tidligere kÌreste, Mette, pludselig findes myrdet. Kort forinden har Daniel vÌret i hendes lejlighed, og han har intet alibi for drabstidspunktet. At han lider af Aspergers syndrom, gør det kun svÌrere for ham at befinde sig i politiets søgelys. Daniel har uendelig viden om Søren Kierkegaard og en meget prÌcis evne til at iagttage sine danske omgivelser; men det hjÌlper ham ikke nu.
Da Mette bliver myrdet, forsvinder ogsü et netop opdaget Kierkegaardmanuskript. I sin taske havde Mette en nøgle til en bankboks, og hun mü have haft pü fornemmelsen, at nogen ville gøre hvad som helst for fü fingre i det hemmelige manuskript, for i bankboksen har hun lagt en ledetrüd til Daniel, som kun han kan tyde. For at rense sig selv for mistanke tvinges Daniel til at tage kampen op mod fortidens spøgelser og tage efterforskningen i egen hünd. Gennem tolkninger af Kierkegaards skrifter kÌmper han for at finde Mettes morder og det forsvundne manuskript.
Kierkegaardmysteriet er en spĂŚndingsfyldt vandring gennem bĂĽde Kierkegaards gamle by og det nutidige København â set gennem en amerikaners øjne.
I modsĂŚtning til i amerikanske byer dytter bilisterne i København aldrig, medmindre der virkelig er tale om en nødsituation, eller det danske lands hold lige har vundet europamesterskabet â og ingen af delene er tilfĂŚldet denne morgen. Ved trafiklyset i Tietgensgade holder cyklisterne i rĂŚkker pĂĽ tre eller fem eller mere efter hinanden og venter pĂĽ, at der skal blive grønt. De fleste af dem er klĂŚdt pĂĽ til at tage pĂĽ arbejde, nogle af dem ganske nydeligt. Efter alle disse ĂĽr forekommer det mig stadig mĂŚrkeligt at se en kvinde i en fornem uldfrakke og med højhĂŚlede støvler pĂĽ sin cykel midt i et befĂŚrdet kryds eller at se en mand i jakkesĂŚt tage sin mobiltelefon frem og placere den pĂĽ styret, mens han kører tommelfingeren ned over den lille skĂŚrm.