John lever et godt liv med sin kone Benedicte og deres to børn, men en blændende smuk sommerdag står han ansigt til ansigt med sin fortid. John har aktier i Balkankrigen, hvor han udførte specialopgaver som skarpskytte.
Katrine trænger til ferie, men konflikter på integrationskontoret og på hjemmefronten truer med at spolere hendes sommerplaner.
Den lille nordjyske turistby Sønderby oser af charme i sommerheden, men under overfladen samles tråde fra fortiden. Johns dybe hemmeligheder truer med at blive afsløret, og Katrine kommer på sporet af den serbiske mafia.
Hvor langt vil et menneske gå for at beskytte sin familie mod sandheden?
SKARPSKYTTEN FRA BANJA LUKA er en selvstændig efterfølger til Natten er deres i serien om Katrine og Sønderby.