Da den tidligere minister Bernhard Clausen dør af et hjertetilfælde, bliver William Wisting hasteindkaldt til et møde på rigsadvokatens kontor. I Clausens hytte er der gjort et fund, der er uforeneligt med billedet af ham som en dygtig og hæderlig politiker, og sagen må opklares, uden at pressen og offentligheden får at vide, hvad det drejer sig om. Wisting sammensætter en hemmelig efterforskningsgruppe bestående af få, udvalgte politifolk – og af datteren Line, der er journalist.

Sporene i flere uløste kriminalsager krydser den afdøde politikers fortid, og tilfældighederne vil, at politikommissær Adrian Stiller og hans cold case-gruppe arbejder med en af sagerne. Modvilligt indser Wisting, at han har brug for Stillers hjælp til at afsløre Bernhard Clausens inderste hemmeligheder.

DET INDERSTE RUM er anden bog i Jørn Lier Horsts cold case-kvartet. Den første er Katharina-koden.