Rapport fra havbunden er en moderne variation af folkevisens Agnete og havmanden. Agnete kommer fra København til en lille sydfynsk ø, hvor hun gifter sig med skibsværftsejeren Birger. Han er en midaldrende borgermand, HUN drages mod eventyr og frihed. Bogen fortæller om hendes tøvende skridt væk fra tryghed og stagnation, ud i et nyt forhold til sømanden Erling. Måske er den frihed, Agnete opnår med sin havmand kun en ny underkastelse? Eller er det begyndelsen til en ny åbenhed? Det vil hun helst tro. Men hun er usikker og finder støtte hos sømandskonerne i det snævre ø-samfund, hvor handlingen udspilles, et spejlbillede af det store samfund med sociale skel og uretfærdigheder og skarpt optrukne fronter mellem miljøerne.