In den beiden ersten Teilbänden sind alle überlieferten Nachschriften zu Hegels Berliner Vorlesungen über die Philosophie der Natur kritisch publiziert worden. Der dritte Teilband enthält die Sekundäre Überlieferung: die umfangreichen Zusätze, die der Hegelschüler Carl Ludwig Michelet im Rahmen der Freundesvereinsausgabe den Paragraphen des zweiten Teils von Hegels Encyklopädie (1830) hinzugefügt hat. Diese Zusätze hat er aus sämtlichen ihm zur Verfügung stehenden Überlieferungsträgern dieses Systemteils kompiliert. Dazu gehören der sogenannte Jenaer Systementwurf III, Hegels Berliner Vorlesungsmanuskript über Naturphilosophie, einige Exzerpte und Notizen sowie vor allem ausgewählte Studentennachschriften zu einigen Berliner Kollegien. Über die Frage jedoch, wie sich die Zusätze im Einzelnen zusammensetzen, herrschte bisher Unklarheit. Mit dem dritten Teilband liegen sie erstmals detailliert aufgeschlüsselt vor; ein quellenkritischer Belegstellenapparat gibt an, an welcher Stelle in welchem Band der Gesammelten Werke sich der Quelltext befindet. Durch diese historisch-kritische Präsentation kann mit den in der Rezeption überaus wirkmächtigen Zusätzen nun philologisch verlässlich weitergearbeitet werden.