Antropolog Daniel White studerer cubansk kultur og seksualitet og har høstet stor anerkendelse for sin forskning. Men da han tager en ung kvindelig forskningsassistent med i felten, går det galt. Han bruger sin magt og sætter hende i en penibel situation sammen med en cubansk elsker.
Caroline Finch ser meget op til Daniel og er begejstret for at tage med ham til Caribien, men da han overskrider hendes grænser, er hun nødt til at træffe et valg, som får afgørende betydning for hendes fremtid.
Den cubanske elsker står klar til at gribe og forføre både kvinder og mænd, hvor der er efterspørgsel på romantik, erotik og kærlighed. Gælder det også Daniel og Caroline?
En cubansk affære er en roman om kærlighed, kultur, moral og det perspektiv, hvorfra man betragter livet – både de andres og ens eget.
Romanen udstiller traditionelle kønsnormer og magtstrukturer og giver samtidig et indblik i den handel med intime ydelser, der finder sted i Cuba.