Gustav, adelsmannen från släkten Vasa, har tagit makten och är nu kung i Sverige. Den forne vännen Hans är på flykt efter att ha begått ett brott i kungens tjänst. Han lämnar sin son Henrik och sin fru Margareta som blivit kung Gustavs älskarinna. I den tyska staden Münster kommer Hans i kontakt med den hemliga sekten ”Vederdöpare”, vilka kämpar för ett påstått idealsamhälle som mer liknar ett skräckvälde med religiös terror. Han flyr staden och återvänder till Sverige men inser att hustrun Margaretas förbindelse med kung Gustav har fått följder han aldrig kunnat föreställa sig. Hans hat mot kungen för honom ut på farliga vägar.
Flyktingen är den andra delen av sex i en historisk romanserie som för lyssnaren tillbaka till det omvälvande och farliga 1500-talet, en tid som inte är alltför olik vår egen.
Den här titeln har tidigare varit utgiven som en del i Uppkomlingen.