Vi befinder os i København sidst i 1700-tallet. Den islandske urmager Jón Sivertsen arbejder på at restaurere et enestående to hundrede år gammelt astronomisk urværk, der står og forfalder i et afsides hjørne af kongeslottet Christiansborg. En sen aften får han til sin store befippelse besøg af selveste monarken, Christian 7., der stadig officielt er konge, men som er blevet skubbet til side af sin egen søn, der opfatter ham som sindssyg og utilregnelig.

Kongen strejfer halvfuld og hvileløs rundt på slottet om natten, og de sene nattemøder foran urværket udvikler sig efterhånden til dybt fortrolige samtaler. Jón fortæller kongen historien om sin far og fostermoder i Island, der begge blev uskyldigt dømt og brutalt henrettet for øjnene af den fortvivlede dreng. En dødsdom, der blev underskrevet af Frederik 5., kongens far.

"Kongen og urmageren" opruller en hjertegribende historie om den danske kongemagts brutale undertrykkelse af den islandske befolkning gennem nådesløs og tilfældig magtudøvelse. Mødet mellem de to mænd, hvor den enes far har henrettet den andens, kommer til at forandre begges liv for altid.