Arthur Parnassus har et godt liv på trods af en traumatisk barndom som forældreløs. Han er forstander på et særligt børnehjem på en fjern ø, og han håber på snart at adoptere hjemmets seks magiske børn. Sammen med sin store kærlighed, den tidligere sagsbehandler Linus Baker, arbejder han hver dag hårdt for at give hjemmets seks magiske børn den kærlighed, han selv manglede som barn.
Men spøgelser fra Arthurs mørke fortid truer med at vælte hans verden, og snart må han kæmpe for sin families fremtid og for, at omverdenen ikke skal betragte ham og børnene som monstre. Oven i det flytter et barn ind, som med stolthed i stemmen omtaler sig selv som netop et monster. Arthur står ved en skillevej. Enten vil han og hans familie komme styrket ud på den anden side, eller også vil alt gå op i ild og røg.
Velkommen tilbage til eventyrhuset. Dette er Arthurs historie.