Sagaen om Emilie er en slægtskrønike fyldt med kærlighedsintriger og hemmeligheder. Vi følger den smukke husmandsdatter Emilie i 1880'ernes Trøndelag i Norge, et samfund med store kløfter mellem rig og fattig.
Emilie ved ikke, hvad hun skal gøre. Halvor, som har været hendes livs kærlighed, er ikke den, hun troede, han var. Hendes drøm om et godt liv med ham er ved at falde fra hinanden. En beslutning skal tages – og Emilie er nødt til at være den, der gør det.