Efter en uheldig episode i Nyhavn, forflyttes jurist og tidligere jægersoldat, William Hammer, til Færøerne, hvor han sættes i spidsen for en særlig gruppe. Gruppen får af britiske MI6 til opgave at opspore en mystisk mand, der måske overlevede et flystyrt i 1970. Manden skal have været ombord på et passagerfly, som forulykkede på øen Mykines i september 1970. Men ingen har set skyggen af ham siden.
Det viser sig hurtigt, at sagen trækker tråde helt tilbage til 2. verdenskrig og til en af Færøernes største erhvervsvirksomheder. Det går også op for gruppen, at de har bevæget sig ind i et minefelt, hvor flere vil forhindre sandheden i at komme frem. Den femte mand er første selvstændige roman i serien om William Hammer og Skanseafdelingen.