Föräldralöse Evan Smoak rekryterades till Orphanprogrammet, ett hemligt projekt där han utbildades till mördare, anlitad av regeringen. Han bröt med programmet och blev Nowhere Man, med uppdrag att hjälpa desperata människor i knipa. Men snart märker han att mäktiga krafter är ute efter honom. Regeringen har eliminerat de andra i Orphanprogrammet och Evan Smoak är ett alltför stort hot.
Länge har Evan legat flera steg före sin förföljare, men han begår ett misstag …
Presidenten erbjuder honom en deal - döda en rik och mäktig man som är för farlig för att få leva, och i utbyte låter hon Evan gå. Men när Evan lämnade Orphanprogrammet lovade han sig själv att endast använda sina krafter för de som verkligen förtjänade det. Nu måste han välja vad som är viktigast - principerna eller livet självt.