Luke Bergmann finder sin bedste ven, Viktor, hængt og hans 4-årige datter, Agnes, liggende livløs på sofaen. Politiet mener, at Viktor har dræbt Agnes og derefter har begået selvmord. Men Luke tror ikke på politiets teori, og han indleder sin egen efterforskning.

Da flere findes døde under lignende omstændigheder, bliver Luke overbevist om, at der er tale om mord, og at motivet skal findes 21 år tidligere, hvor Viktor og de andre var involveret i en sekt i Karlskrona. Sammen med den kvindelige betjent Jonna Gustafson kaster Luke sig ud i et hektisk kapløb med tiden for at stoppe morderen.

”Hjernevasket” bygger på en sand historie om, hvordan unge mennesker manipuleres ind i sekter, og hvor let vi lader os påvirke af mennesker omkring os.