En velfortalt og spændende historisk roman som foregår primo 1700-tallet. Aja ajaja bygger på autentiske kilder.
Hans Egede, den dansk-norske præst, udsendes til Grønland for at finde de nordboere, som man stadig håber, er i live efter de blev udsendt, men det er de desværre ikke. I stedet giver Hans Egede sig til at missionere blandt de "vilde" indfødte, hvilket der kommer der meget ulykke ud af.
En lærenem og interesseret ung eskimo, Poq sendes til Danmark for, at kongen, Frederik den 4. ved selvsyn kan iagttage denne inuit, og samtidigt overbevises om nytten i forsat at støtte Hans Egedes mission.
Aja ajaja er delt op i to kronologisk historier: én handling ser sceneriet fra dansk synsvinkel, og den anden skildrer virkeligheden gennem inuit-øjne. Hovedpersonen, Poq virker rørende med sin naive uskyld og sin menneskelige komiske forfængelighed.
På den anden side står Hans Egede som en streng sort protestant, der tror på tvang, frygt og tugt i forbindelse med reklame for fromhed og udbredelse af kristendom.