En frostbiten majdag lämnar ensamseglaren och kulturskribenten Anton Sköld mobiltelefonen kvar hemma på hallbänken och ger sig ut på havet i sin mahognykoster. I en artikelserie har han försökt ringa in vad han anser vara en svensk mentalitet i förändring och märkliga saker har börjat hända. Vill någon honom ont och varför?
På Sandhamn möts han av ett leende som han omöjligen kan glömma. Det blir början på en
förälskelse som ömsom bär mot himlen, ömsom får honom att vrida sig sömnlös bland styrbordskojens lakan.
Anton har en egendomlig känsla av att den undanglidande Rebecka, redan då de träffas, vet något om honom. Kärleken är långt ifrån okomplicerad, den blir till ett allvar där sanningar och lögner är svåra att skilja. Attraktionen blandas med frågetecken och en tilltagande oro.
En sällsam sommar är en berättelse om destruktiv kärlek, om att vända tidens ideal ryggen och att kämpa för att behålla sin orientering.