Ă ret er 1940.
I Vedby emmer alt af fred og idyl indtil en tidlig morgen â den 9. april. Ligesom resten af Danmark er familien Madsen skrĂŚmte over at se tyskernes fly over Danmarks himmel. Gustav og Agnete ser hinanden i øjnene, og de kan mĂŚrke de bange anelser, som fylder deres kroppe. Deres lille søn, Jørgen, kommer løbende ind til dem, og imens Agnete holder ham i sine arme, spekulerer hun pĂĽ, hvad fremtiden mon vil bringe dem.
Hemmelighederne der ikke kunne siges er en familiekrønike, som følger familien Madsen igennem ĂĽrene 1939-1981. Gustav og Agnete gennemlever Anden Verdenskrig som et ĂŚgtepar, der kĂŚmper for Danmark. Vi følger dem i romantiske, magtesløse, tĂĽrevĂŚdede og lykkelige øjeblikke. Vi ser dem prøve at komme videre og inderligt hĂĽbe pĂĽ, at deres børn ikke kommer til at begĂĽ de samme fejl, som de gjorde â mĂĽske uden held.