Den unge Josef er træt af det indspiste og intrigante forskermiljø, men knap har han overstået det afsluttende ph.d.-forsvar på DTU, før han er på vej til Ecuador for at hjælpe en kendt medicinalforsker. I forsøget på at udrede forskningsprojektet, må han se sig jagtet af såvel ecuadoriansk politi som skruppelløse videnskabsfolk.
Den tabte by er Jesper Lemmichs romandebut