Skyerne Over Vesterbro er en tempofyldt historie fra Istedgade og omegn. Her forsøger 32-ürige Jonas desperat at fü magt over de tilfÌldigheder, der pludselig Ìndrer hans liv. Pü Københavns Hovedbanegürd støder han ind i den slovakiske pige Kassia. Efter kort tid forsvinder hun sporløst. De nÌste 48 timer jagter Jonas Kassia og sandheden om hende. Imens forfølges han af ukendte mÌnd, der tilsyneladende ikke kun er ude efter ham.