Agentti Maggie O'Dell ja apulaisjohtaja Cunningham luulevat uhkauksen koskevan Quanticoa, FBI:n päämajaa. Todellisuudessa maalitauluna ovat he itse.
Tappajan taktiikka antaa ymmärtää hänen olevan innokas rikollisten ihailija. Tappaja käyttää ihailemiensa rikollisten juonia ja yksityiskohtia: Beltway-ampujan lausetta, Unabomberin vihjettä, pernaruttotappajan toimitustapaa. Aseina ovat tappavat virustartunnat, jotka ovat näkymättömiä ja täysin yllättäviä. Uhrit vaikuttavat sattumanvaraisilta. Todellisuudessa kostonhimoinen tappaja on heidät tarkasti valinnut. Rokotetta on vain rajallisesti, eikä sitä ole edes hyväksytty.
Maggie tuntee vaarallisen mielen, mutta joutuu nyt taistelemaan tuntematonta vastaan eristysosastolla, jossa yritetään saada selville, lisääntyykö tappava virus jo Maggien omassa elimistössä. Maggie pelkää kuolevansa ennen kuin pystyy estämään tätä kaikkien aikojen vaarallisinta ja älykkäintä murhaajaa lähettämästä maailmalle tappavaa epidemiaa...