Som ung tilbragte amerikaneren Daniel Peters et år i Danmark som udvekslingsstudent. Nu 25 år senere arbejder han som oversætter på Kierkegaard Forskningscenteret i København, da hans chef og tidligere kæreste, Mette, pludselig findes myrdet. Kort forinden har Daniel været i hendes lejlighed, og han har intet alibi for drabstidspunktet. At han lider af Aspergers syndrom, gør det kun sværere for ham at befinde sig i politiets søgelys. Daniel har uendelig viden om Søren Kierkegaard og en meget præcis evne til at iagttage sine danske omgivelser; men det hjælper ham ikke nu.
Da Mette bliver myrdet, forsvinder også et netop opdaget Kierkegaardmanuskript. I sin taske havde Mette en nøgle til en bankboks, og hun må have haft på fornemmelsen, at nogen ville gøre hvad som helst for få fingre i det hemmelige manuskript, for i bankboksen har hun lagt en ledetråd til Daniel, som kun han kan tyde. For at rense sig selv for mistanke tvinges Daniel til at tage kampen op mod fortidens spøgelser og tage efterforskningen i egen hånd. Gennem tolkninger af Kierkegaards skrifter kæmper han for at finde Mettes morder og det forsvundne manuskript.
Kierkegaardmysteriet er en spændingsfyldt vandring gennem både Kierkegaards gamle by og det nutidige København – set gennem en amerikaners øjne.
I modsætning til i amerikanske byer dytter bilisterne i København aldrig, medmindre der virkelig er tale om en nødsituation, eller det danske lands hold lige har vundet europamesterskabet – og ingen af delene er tilfældet denne morgen. Ved trafiklyset i Tietgensgade holder cyklisterne i rækker på tre eller fem eller mere efter hinanden og venter på, at der skal blive grønt. De fleste af dem er klædt på til at tage på arbejde, nogle af dem ganske nydeligt. Efter alle disse år forekommer det mig stadig mærkeligt at se en kvinde i en fornem uldfrakke og med højhælede støvler på sin cykel midt i et befærdet kryds eller at se en mand i jakkesæt tage sin mobiltelefon frem og placere den på styret, mens han kører tommelfingeren ned over den lille skærm.
